A série segue a relação de Akira Tsubaki e Urabe Mikoto. Urabe é uma estudante transferida que recentemente entrou para a escola de Tsubaki. Urabe é pouco sociável e dorme durante as aulas, essas atitudes fazem com que seus colegas de classe mantenham uma certa distância dela, achando que ela é estranha. Tsubaki descobriu após um tempo que Urabe têm uma habilidade especial. Que habilidade é essa? O que aconteceu com Urabe e Akira? O que será que essa menina tem de tão misterioso?

Títulos Alternativos:
US/DE/EN/MAL: Mysterious Girlfriend X | CN: 谜样女友X | FR/BR/ES/PL/MAL: Nazo no Kanojo X | IT: Fidanzata Misteriosa X | PT: Namorada Misteriosa X | RU: Загадочная девушка Х | UA: Таємнича подружка Х | TW: 謎樣女友X | CZ: Nazo no kanojo X | MX: Nazo No Kanojo X | KR: 수수께끼 그녀 X | ALT: MGX | ALT: NazoKano | JA: 謎の彼女X | JA: Nazo no Kanojo X: Mysterious Girlfriend X