O Dr. Nuvo Vindi é preso, mas o vírus infecta Rex, Padmé, Ahsoka e outros clones. Eles terão que impedir que os dróides restantes escapem, e Obi-Wan e Anakin terão que ir a Yego, um planeta amaldiçoado para conseguirem a cura do Vírus Azul. O planeta é amaldiçoado pelo fantasma de Dron, antigo governador do planeta, e terão que voltar a Naboo antes que Ahsoka, Rex, Padmé e os clones morram por causa do vírus.

Títulos Alternativos: US/DK: Mystery of a Thousand Moons | FR: Les mystères des mille lunes | DE: Das Geheimnis der Monde | IT: Il mistero delle mille lune | ES: El misterio de las mil lunas | HU: Az ezer hold rejtélye | PT: O mistério das mil luas | JP: 千の月の謎 | CZ: Tajemství tisíce měsíců | RU: Тайна тысячи лун | TR: Bin Uydunun Gizemi | SK: Záhada tisícich mesiacov | BR: O Mistério das Mil Luas | GR: Το μυστήριο των χιλίων φεγγαριών | PL: Tajemnica tysiąca księżyców | CN: 千月之谜 | SE: Mysterium på Tusen Månar | KR: 천 개 위성의 미스터리 | NL: Mysterie van de duizend manen | TH: ปริศนาพันจันทรา | HK: 千月之謎