O passado de Makina é revelado. Ao ser ordenado matá-la, Yuuji resolve fugir do Instituto para protegê-la.

Títulos Alternativos: FR: Les graines de l’Arbre-Monde 2 | US: Seed of the World Tree II | BR: Semente da Árvore do Mundo, Parte II | KR: 세계수의 씨Ⅱ | DE: Die Saat des Weltenbaums – Teil 2 | JP: セカイ樹の種 II | CN: 世界树的种子Ⅱ | PL: Nasienie Drzewa Świata II | TW: 世界樹的種子 II | IT: Seme dell’albero del mondo II | MAL: Grisaia no Kajitsu | ALT/MAL: Le Fruit de la Grisaia | JA: グリザイアの果実 | EN/MAL: The Fruit of Grisaia