Com a semana de recrutamento de clubes acontecendo na Escola de Magia, Honoka e Shizuku, que são estudantes excepcionais, são convidadas para participarem de vários clubes. Quando elas se veem cercadas por membros de clubes, Eimi vem em seu socorro, e as três se tornam amigas rapidamente. No caminho de volta da escola para casa, Honoka e suas amigas testemunham Tatsuya, que recentemente se tornou membro do comitê disciplinar, sendo atacado por alguém. Eimi, motivada por seu interesse nesse incidente e em Tatsuya, decide investigar quem é o agressor. Honoka e Shizuku são puxadas para a investigação de Eimi e as três garotas acabam formando o Clube de Detetives das Garotas.

Títulos Alternativos: US: The Girls’ Detective Club is here! | JP: 少女探偵団、始動よ！ | IT: Il club investigativo | KR: 소녀탐정단, 출동이야! | DE: Hier kommt der Mädchen-Detektivclub! | CN: 少女侦探团，出动！ | BR: Clube de Detetives das Garotas, vamos começar! | TW: 少女偵探團，出動！