A história começa numa cidade futurista chamada Romdo, construída para a proteção dos cidadãos após o apocalipse ambiental global. Nesta utopia, humanos e androides coexistem uns com os outros, num ambiente de total controle. Uma série de assassinatos cometidos por robôs descontrolados infectados por um vírus chamado Cogito começa a estragar a delicada ordem social. Por trás dos panos, o governo vem conduzindo experimentos secretos com uma misteriosa forma de vida humanoide chamada Proxy, a qual supostamente teria a chave para a sobrevivência da humanidade.

Títulos Alternativos:
US/IT/FR/BS/ES/DE/BR/PL/MX/PT/MAL/EN: Ergo Proxy | TW/CN: 死亡代理人 | RU: Эрго Прокси | KR: 에르고 프록시 | IL: ארגו פרוקסי | UA: Ерґо Проксі | UA: エルゴプラクシー