Anos após a humanidade vencer a batalha contra o Nirvash e Eureka 7, tudo parecia tranquilo, até que, das ruínas das batalhas, surgiu uma outra civilização: humanos de uma Terra paralela. Enquanto as duas humanidades tentam conviver, apesar de grupos extremistas, a ameaça dos scabs continua. Um grupo terrorista descobre uma garota os mesmos poderes de Eureka, e agora cabe a Anemone e à própria Eureka protegê-la para que seus poderes não sejam usados para levar o mundo novamente à beira da destruição, ou além.

Títulos Alternativos:
US: Eureka: Eureka Seven Hi-Evolution | BR: Eureka: Eureka Seven Hi-Evolution 3 | CN: 交响诗篇：超进化3 | KR: 교향시편 유레카 세븐 하이에볼루션 3 | IT: Eureka Seven – Hi-Evolution 3 – Eureka | TW: EUREKA／交響詩篇艾蕾卡 7：HI – EVOLUTION | FR: Eureka Seven Hi-Evolution – Film 3 | HK: EUREKA／交響詩篇艾蕾卡 7：HI – EVOLUTION