Natsu e seus amigos partem para um novo continente para fazer a Missão de 100 Anos, uma missão que jamais foi concluída por nenhuma outra guilda e foi proposta pela primeira guilda, Magia Dragon.

Natsu e seus amigos chegam em Ermina e descobrem algo suspeito ao passarem uma noite no hotel. Enquanto isso, na Fairy Tail, enquanto as suspeitas sobre Touka aumentam, Jellal aparece em sua procura.

Em meio à batalha de Natsu e seus amigos contra Kiria e Madmall, o mar se abre e aparece Mercphobia, o Deus Dragão da Água. Mas ele será um amigo ou inimigo?

Jellal encontra Touka, a Maga Branca, mas quando consegue confrontá-la, ela é protegida por Laxus. Enquanto isso, Erza, Natsu e Wendy são feitos de prisioneiros. Cabe a Lucy fazer o possível para salvá-los!

A Fairy Tail prende Touka depois de descobrir que ela tinha uma dupla personalidade e era realmente a Maga Branca. Enquanto isso, Natsu e seus amigos encaram os comedores de dragão.

Mercphobia, o Deus Dragão da Água, perde o controle e sobe o mar para o céu. Natsu e seus amigos precisam juntar suas forças para derrotá-lo. Mas será que o fogo de Natsu será capaz de derrotar a magia de água? No meio da batalha, aparece alguém no mar no céu. Será um amigo ou inimigo?

Natsu e seus amigos conseguem derrotar Mercphobia e salvar a cidade que ficou à beira da destruição. Agora eles precisam seguir para o próximo ponto da sua jornada, mas por onde eles devem começar?

Natsu e seus amigos conhecem a guilda com seus sósias, a Fairy Nail. Em seguida partem em busca de Aldoron, o Deus Dragão da Madeira, e segundo no caminho para cumprir a missão de 100 anos.

Natsu e companhia descobre a verdade sobre o que aconteceu com seus companheiros de guilda. Agora eles precisam fazer o possível para trazê-los de volta enquanto a Maga Branca avança com seu plano.

Ao mesmo tempo que se descobre o plano da Maga Branca, Natsu e seus amigos se veem encarando seus colegas de guilda. Com as batalhas ficando mais intensas, novos inimigos também aproveitam para entrar na batalha.

Erza luta contra Laxus para impedir que o orbe seja destruído. Enquanto isso, Natsu e Happy encontram Touka e se aproximam um pouco mais da verdadeira identidade dela.